Le mycélium est l'appareil végétatif des champignons, la croissance et ramification du mycélium est comparable à la phase végétative du cycle de croissance. Plus vous pouvez produire de mycélium de façon fiable, plus vous pourrez cultiver de champignons. Le mycélium tente de coloniser et de décomposer tout matériau qu’il peut. Il exsude des enzymes (qui favorisent la décomposition) à la surface du substrat, et les nutriments qui sont rendus disponibles sont absorbés de nouveau dans le réseau mycélien. Ce réseau mycélien va continuer à se développer jusqu’à ce qu’il manque une source de nutriments frais pour coloniser ou jusqu’à ce qu’il rencontre un autre organisme compétitif, tel qu’un contaminant dans la culture.
Pour la culture, le mycélium est généralement cultivé sur un substrat à base de céréales dans des bocaux de mise en conserve pendant la phase végétative. Certains exemples courants de substrats incluent un mélange de farine de riz brun et de vermiculite dans des bocaux d'une demi-pinte, ou un grain de seigle hydraté dans des bocaux d'une pinte. Tout substrat doit être stérilisé à l’aide d’un autocuiseur avant d’être inoculé avec du mycélium. Cela tue les organismes compétitifs qui peuvent contaminer votre culture et inhiber sa croissance.